நடந்து முடிந்த உலக கோப்பையில் நியூஸிலாந்திடம் இந்தியா தோல்வியடைந்ததிலிருந்தே தோனியின் மீது விமர்சங்கள் அதிகமாக எழத் தொடங்கின. யுவராஜ் சிங்கின் அப்பா யோகராஜ் சிங் முதற்கொண்டு பலர் தோனி மீது குற்றம் சாட்டினார்கள். மேலும் தோனி உலக கோப்பையில் மோசமாக விளையாடியதால் வெஸ்ட் இண்டீஸ் சுற்று பயண ஆட்டத்திற்கு அவர் தேர்ந்தெடுக்கப்படுவதில் சர்ச்சை எழுந்தது.